在轨道交通网络一体化方面，规划提出国铁干线网络“二纵三横”布局和城际轨道交通网络“四纵五横”布局。记者注意到，连接珠海的城际轨道交通网络中，除了已经通车的广珠城际线外，规划还提出了广佛江珠城际线、广中珠澳城际线、珠海-斗山城际线、珠海市区至珠海机场城际轨道、珠海-深圳城际轨道等。
建设一体化方面，规划提出珠海港以发展石油基地、煤炭基地、海洋装备制造基地等大宗散货运输和集装箱运输为主，逐步打造珠三角新的散杂货中心港和珠江西岸集装箱干线港。中山港以发展集装箱喂给运输为主，江门港以能源、原材料等散杂货运输为主。